胃 癌
胃癌是全球致死性排行第三的惡性腫瘤疾病，且由于東西方飲食生活習慣差異，以我國為首的東亞諸國發病率尤為突出。胃癌具有復雜的患者組織病理及基因組異質性，使臨床患者分層與精準醫療面臨嚴峻挑戰。因此，有效鑒定不同胃癌患者基因組中潛在共性特征，對指導臨床用藥方案、預測療效及患者預后具有重要意義。
近日，允英醫療攜手上海長征醫院，基于允英自主研發的高效DNA提取技術DNAplus?、液相雜交捕獲測序技術AllNGS?，聯合生物信息大數據庫分析驗證，在文章“PIK3CA somatic mutations as potential biomarker for immunotherapy in elder or TP53 mutated gastric cancer patients”中，首次報告對于老年或攜帶TP53突變的胃癌患者，存在PIK3CA基因體系突變將導致患者響應免疫治療的幾率提升。相關文章發表于SCI雜志Clinical Genetics（DOI: 10.1111/cge.14260，IF=4.296），第一通訊作者為上海長征醫院胃腸外科王偉軍主任，由允英醫療CEO張道允博士及研發總監鞏子英博士擔任共同通訊作者1。
本研究總計入組了288例胃癌患者，其中男性198人（68.8%），女性90人（31.3%）。患者平均年齡60歲，中位年齡61歲，男女隊列年齡無顯著性偏差。所有入組患者均提供腫瘤組織樣本，同時使用允英采血管采集并保存配對血液樣本。樣本中核酸分子經DNAplus?富集提取后，應用允英AllNGS Panel 639?實體瘤全程管理產品，基于Illumina nextSeq550二代測序平臺在組織與配對血液樣本中檢測了與腫瘤發生、發展及患者用藥指導、預后評估相關的639個基因的全部外顯子與部分內含子上所攜帶的基因胚系及體系變異。
結果發現，入組患者所檢出突變基因與患者基線間相關性極為復雜，為胃癌患者基因組具有高度異質性的論點提供了有力支持。值得注意的是，不同年齡段（≥60歲或＜60歲）患者間具有不同的突變背景，表明年齡可能是胃癌患者基因組圖譜鑒定的重要影響因素。此外，僅有43.8%（126人）未攜帶TP53體系突變，且其中多達41.3%（52人）的TP53野生型患者中罕見基因組體系突變，表明其腫瘤突變負荷極低，提示TP53可能是胃癌患者分層的一個潛在分子特征。
隨后，本研究將患者分為TP53突變型及TP53野生型隊列，并檢查了突變頻率最高的20個基因與TP53間的協同或拮抗突變模式。結果發現，TP53突變與ARID1A、CDH1、KRAS、LRP1B、PIK3CA突變以及HER2基因擴增表現出統計學顯著性相關（p<0.05）。
為了深入評估是否可以基于TP53突變特征建立臨床分層管理策略，本研究進一步調查了TP53突變攜帶者與非攜帶者的腫瘤突變負荷（Tumor mutation burden，TMB）與不同基因突變間的潛在關系。結果發現，攜帶PIK3CA突變的患者表現出更高的TMB評分，這一差異在野生型TP53患者隊列中表現得更為明顯。有趣的是，在年齡≥60歲的患者群體中也表現出了PIK3CA體細胞變異與高TMB評分間極為顯著的相關性。
上述結論在包含873名胃癌患者基因組信息的Cbioportal公共數據庫中得到了驗證，證實了在以TP53突變狀態和年齡分組下，CDH1、HER2和PIK3CA與TMB的相關性。我們進一步對35名曾接受了免疫治療的胃癌患者進行了生存分析，發現在TP53突變或年齡≥60歲的患者群體中，攜帶PIK3CA突變的患者能夠更好的響應免疫治療，患者總生存期相比非攜帶者更長、預后更好，盡管這一趨勢由于樣本量較小而未表現出統計學顯著性差異。
綜上，本研究首次報道了PIK3CA聯合TP53或年齡特征對胃癌患者免疫療效進行評估具有潛在貢獻，相關成果為臨床胃癌患者的分層提供了新的思路與視角，并為指導患者個性化的精準醫療及免疫藥物獲益性預測提供了重要參考依據。
允英醫療 NGS Panel 639
允英醫療 NGS Panel 639產品是基于允英已有的二代測序平臺（Illumina Nextseq 500/550）和自主研發的高效率雜交捕獲AllNGSTM技術開發的實體瘤高通量測序Panel，是一個免疫+靶向+化療一站式檢測平臺。一次檢測即可得到腫瘤突變負荷（TMB）和微衛星不穩定性（MSI）結果，精準指導PD-1/L1用藥；檢測腫瘤靶向相關基因，精準指導靶向用藥；檢測藥物代謝相關基因，精準指導化療用藥；檢測腫瘤遺傳相關基因，篩查遺傳性腫瘤。
適用人群
初診實體瘤患者：第一時間為臨床用藥提供更佳一線治療方案;
術后需要輔助治療患者：術后全面指導治療；
復發或標準治療失敗的實體瘤患者：提供可能異病同治方案，考慮免疫治療。
檢測周期
5-7個自然日
參考文獻：
1. Yao J, You Q, Zhang X, et al. PIK3CA somatic mutations as potential biomarker for immunotherapy in elder or TP53 mutated gastric cancer patients. Clin Genet. 2022;doi:10.1111/cge.14260
關于
允英醫療
YUNYING
允英醫療以長三角區域為中心，輻射全中國，公司致力于打造癌癥精準診療的新型生態圈，綜合運用基因突變檢測、基因甲基化檢測、基因編輯重組等生物科技的前沿技術，全方位提供從癌癥早期精準篩查、癌癥靶向用藥檢測、癌癥治療藥物研發一體化的腫瘤精準醫學解決方案。目前在上海、浙江及青海共設有三家實驗室。
允英醫療成立至今，順利通過由國家衛健委臨檢中心、國家病理質控中心、美國病理學會等機構組織的室間質評。檢驗能力獲得了美國病理學會PT認證、國際ISO13485認證，部分試劑盒通過歐盟CE認證。目前允英已累計為二十余萬例腫瘤患者提供精準檢測服務，為國內腫瘤精準醫療領域開拓者。同時允英秉承“嚴謹、高效”的理念，堅守分子診斷技術創新與應用探索，為腫瘤精準醫療與伴隨診斷領域的茁壯發展貢獻力量。
